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使用中のマシンに ~/.ssh/config ファイルが存在する場合は鍵ファイルを指定せずに~/.ssh/configに記述します。
Host <ホスト名> User <ユーザー名> Port <ポート番号> HostName <ホスト名> IdentityFile ~/.ssh/<秘密鍵ファイル名> TCPKeepAlive yes IdentitiesOnly yes
これで Transmitからは ユーザー名とホスト名とSFTPを選択した状態で接続します。
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